9月初，台塑集團一名高級主管入境上海後「失蹤」，經媒體曝光後，陸委會和台塑集團才證實他被限制出境；國台辦發言人朱鳳蓮25日表示，「這是一起台胞涉嫌虛假申報致使偷逃稅款的經濟案件」，並批陸委會借此誤導輿論，恐嚇台灣民眾。
海基會副董事長羅文嘉7月12日曾表示，大陸31個省級行政區已有超過20個省市掛牌成立「警稅合成作戰中心」，結合警察、公安及稅務機關搜集大數據及各種訊息平台資料，查緝逃漏稅，加上大陸執法實務上會倒追查稅30年，只要被查到，都可能面臨巨額罰金以及刑事、行政責任。
羅文嘉還根據目前公開資料表示，許多台灣上市公司已因大陸這個查稅專案而面臨巨額罰款。
至於入境大陸後「失踨」的台灣人郭宇軒，朱鳳蓮透露，郭宇軒自8月27日抵達大陸後，涉嫌在多地實施詐騙犯罪行為，被有關部門依法調查，目前案件正在偵辦中；大陸有關方面嚴格依法辦案，依法保障他的合法權益。
朱鳳蓮強調，依法打擊各類違法犯罪活動，積極維護兩岸同胞生命財產安全和合法權益是大陸一貫的態度；至於兩岸協議執行受到影響的原因，眾所周知。
大陸近日還立案偵查三名國軍現役涉及駭客行為，朱鳳蓮指出，賴清德當局背地裡指使、操縱台灣軍情機構對大陸實施網路攻擊破壞，顛倒黑白、散佈謠言，大肆詆毀大陸政治制度和方針政策，一味挑唆兩岸對立對抗；大陸國家安全機關是依法懲獨的正義之舉。
