入冬後日本全國氣溫急遽下降，再次進入呼吸道傳染病的流行期。日本厚生勞動省示警，最近一周全國各地的新冠肺炎和流感疫情同時大爆發，統計數據顯示，流感患者已超過34萬人，比前一周增加近一倍。受到這波流感影響，全國已有1400多所學校採取了部分或全校停課等措施。
綜合《日本放送協會》（NHK）與《朝日新聞》報導，根據日本國立感染症研究所的統計，截至本月8日的一周，全國約5000家醫療機構通報的流感患者人數達44673人，比前一周增加了2萬多人，根據此數據，全國患者人數估計為34.7萬人，較前一週增加約1.9倍。
冬季感染新冠病毒的人數往往也會增加，根據厚生勞動省的數據，上周每個機構的新冠肺炎確診人數為3.07人，已連續第二周增加。截至上周日（8日）的一周內，全日本確診數已逾1.5萬人，比前一周增加3千多人，連續兩周增長。統計資料顯示，2023年仍有38086人死於新冠病毒，呼籲民眾需要繼續保持警覺。
同時透過人際接觸和飛沫傳播的支原體肺炎（黴漿菌肺炎）病況也十分猖獗，今年9月迄今每周感染人數都創下歷史新高。上月（11月）底起廣受關注的「蘋果病」（傳染性紅斑）在關東地區持續流行，雖然症狀通常很輕微，但如果孕婦被感染可能導致流產。
而面臨多種呼吸道疾病患者暴增的情況下，日本最嚴重的問題之一是止咳藥和抗生素等必需品的短缺。有明家庭藥局（有明ファミリー薬局）的藥劑師小林和正表示，通常訂購後24小時內就能收到的藥品，現在至少需要一至二周的時間。目前主要短缺藥品包括：
止咳糖漿，幾乎所有藥局都缺貨
兒童用抗生素，大城市和農村地區都缺貨
陣痛止熱藥：超過70%的藥局出現配送延遲的情況
維生素補充劑：庫存已減少50%以上
為了遏止感染蔓延，日本政府宣布了地區重新分配藥品、加強疫苗推廣接種活動等緊急措施。專家預計，季節性流感將在明年（2025年）一月中旬達到頂峰。而為了解決藥品短缺問題，厚生勞動省正與海外供應商交涉，緊急進口兒科抗生素和退燒藥，也指示地區藥局分配庫存，優先考慮兒科患者。儘管部分藥局在與經銷商重新談判中取得了成功，但藥劑師仍警告，解決藥品短缺問題可能需要數周或數月的時間。
