金門陸船翻覆致2死事件近滿月，國民黨立委陳玉珍今（12）日在立院針對大陸清淤船進我金門禁限制水域，質詢行政院長陳建仁及海委會主委管碧玲。兩人斬釘截鐵表示，陸船不被允許進我禁限制水域，但陳玉珍拿出交通部公告直接打臉，陸委會主委邱太三還出面證實陳玉珍所言為真，令外界看到執政黨政院橫向聯繫不彰，極不用心的現象。
214金門漁船事件後，大陸近日多艘清淤船進入金門禁限制水域作業，陳玉珍對此質詢「大陸船可不可以進我禁限制水域？」陳建仁秒回「不可以啊！」陳再追問「誰告訴你不可以？」陳建仁當場語塞，管碧玲出手救場說「根據兩岸人民關係條例」；陳玉珍當場痛批陳建仁跟管碧玲，處理大陸事務卻連兩岸間的歷史過程都不了解。
陳玉珍表示，「根據交通部104年12月公告，104年12月17號開始實施，運送客貨輪經過金門禁限制水域，進入大陸地區廈門港，是被允許的好嗎？」陸委會主委邱太三隨後證實這份文件說，「對，委員你提到重點，在劉五店航道雙方有協議過，所以才有這份公文。」
陳玉珍批評，民進黨政府遇到問題都一樣，都沒做跨部會協商，陸委會也沒充分告知其他部會，讓第一線海巡非常辛苦，海委會不知有被允許，院長也不知被允許，代表跨部會溝通跟協商很弱，尤其攸關兩岸問題，過去我們跟大陸累積很多善意，有很多相關法令可解決問題，不用走到那麼劍拔弩張，讓金廈海域小事變國際大事，跨部會協商以後一定要進行。
陳建仁對此回應，會加強跨部會溝通。陳玉珍並建議此事可以採「紅會模式」，民間對民間，邱太三說，這是可選擇的項目，其實原來已談到一個程度，有的有共識，有的各自政治上有堅持，才會各自回去請示，還是會繼續進行。
陳玉珍還說，就她掌握，大陸並未在協商過程中，要求我們要把海巡弟兄送去對岸送審，絕沒這件事。陳建仁反問，「委員你怎麼看得到？談判是秘密的，連妳都知道談判內容，那這機密好像就沒被遵守。」陳建仁與管碧玲不斷強調要遵守保密，陳玉珍則說，對方並未告知全部的開會內容，但有的事情就是有，沒有就是沒有，不要再給兩岸形勢添柴火。
