經常聽到台灣人在海外遭遇重大車禍或突發急症，但要接回台灣搶救和治療，專機費用不是一般人負擔得起；與此同時，空軍有15架行政專機，負責接受正副總統、高級將領，有台商就質疑，台灣幅員這麼小，為何需要這麼多行政專機，若能撥出部分行政專機，協助海外急症台灣人返台就醫，豈不完美？
據醫界人士表示，從中國、日本等鄰近亞洲地區包醫療專機飛回台灣，一趟就要約新台幣200萬元上下，非洲等跨洲回台專機更在1000萬元以上，新冠疫情期間，返台醫療專機要價更高。因此，台灣人如果在海外染疫，只能就地就醫，聽天由命，還有人因此命喪異鄉，與親友天人兩隔。
據中華民國空軍臉書介紹，空軍專機隊是在1946年12月1日成立於南京，當時為因應特殊空運需要，由空軍第10大隊為基礎成立專機組，負責中央政府官員與國軍高級將領行政專機工作。1948年遷台後，1955年改隸空軍松山基地大隊，更名為專機中隊，並曾於1958年八二三砲戰期間支援運補任務。
1983年8月1日，專機中隊再擴大整編為專機隊至今，目前有15架行政專機，包括總統專機波音737-800（空軍一號）、軍事首長使用的福克50專機與畢琪1900專機。
除正副總統、高級將領外，行政院長等行政首長也會使用行政專機，2022年11月期間，空軍專機隊一架FK-50型機被發現降落桃園機場，媒體指是時任行政院長蘇貞昌輔選時使用，遭批公私不分。空軍則聲明，依申請使用作業規定執行，與歷任政府並無不同。
依國軍規定，福克50專機必須是有國軍上將層級的軍事首長搭乘使用，畢琪1900專機則為中少將級將領及政府重要官員搭乘使用。
