日前環境部發函各政府單位及公家機關，稱15樹種經證實會大量排放異戊二烯（Isoprene），容易衍生臭氧致影響空氣品質，建議各單位日後新植樹時避開。該函文引起林業專家反彈，認為將空污歸咎於種植特定樹種並迴避種植是本末倒置。最後環境部為免爭議將該函作廢，環境部長彭啟明亦澄清從未禁止種植特定樹種。
環境部6月21日致函眾單位表示，臭氧（O3）生成之前驅物氮氧化物（NOx）及揮發性有機物（VOCs）污染排放，除了來自工業、交通污染，亦包含生物源（植物）污染。為減少衍生性臭氧空氣污染問題，環境部整理出15種高排放異戊二烯之樹種，銀葉樹、烏心石、楓香、豬腳楠、台灣肖楠、水黃皮、水柳、福木、棋盤腳、野牡丹、土沉香、槲樹、刺桐、鴨腳木及厚殼桂，建議在新植樹時避開上述物種。
中興大學森林學系特聘教授王升陽提出異議，認為環境部公告內容之準確性待商榷，再者，異戊二烯是植物在高溫環境下為了保護自身，增強抗熱能力而產生的，除了被點名的15個樹種，蓮霧、芒果等植作物也會大量釋放異戊二烯，但在環境變遷，持續高溫的環境下為了減少空污而禁種樹種、水果，並不合理。
王升陽進一步說明，異戊二烯與氮氧化物反應產生臭氧，導致空氣汙染的情況確實存在，但反應過程其實很複雜。因異戊二烯存在空氣中的時間短，且形成臭氧還需要異戊二烯外的反應物，甚至，在氮氧化物濃度低的環境中，異戊二烯反而可能幫助分解臭氧。因此，王升陽認為與其特意管制樹種種植，不如關注如何減少人為污染物排放。
林業專家憂心環境部函文使特定樹種污名化，在爭議延燒下，環境部邀請農業部、林業及自然保育署、林業試驗所及林業學者專家召開會議討論並達成共識，為了避免民眾產生誤解，決議將該函作廢。彭啟明也澄清，環境部鼓勵各界種樹，並未禁止種植特定樹種，表示植樹時應全面考量各種因素，以達到最佳效果，具爭議之函文為環境部研究計畫之成果，非公告或行政指導，為避免外界錯誤引用造成誤解及爭議，該函予以作廢。
