控制碳排放已成全球課題，台灣自不例外，做為碳排和用電大戶，台灣醫療院所溫室氣體排放量占全國排放比例近4.6%，未來勢必面臨減碳議題。對此，今天（21日）出席台灣醫務管理學會年會的衛福部長邱泰源爆料，「賴總統曾致電罵了彭啟明」，指「把這件事弄得這麼大條，有沒讓醫療院所有錢做這件事？」彭啟明稍後證實了此事，說總統確實有致電關切。不過對行政團隊是否網內互打，政院方面說，大家都是求好心切，無關負面批評。
衛福部長邱泰源今天出席台灣留管學會年會時說，賴總統曾「致電罵了環境部長」。他表示，環境部正研擬支持醫療機構減碳的辦法，但仍無碳費撥款計畫，衛福部將持續了解各國運作方式，爭取碳費協助醫療機構減碳。
對此，環境部長彭啓明今證實，賴總統確實有致電關心，他說，環境部日前與衛福部共同推動綠色醫療，賴總統看到新聞提到台大醫院、榮總、三總一年電費好幾億，沒有別的經費再致力節能減碳，因此致電給他，希望幫助醫療院所。環境部因此與經濟部、金管會展開合作，導入保險基金資金來幫助醫療院所，進行深度節能。
此外，彭啓明也證實邱泰源向他提到盼部分碳費能撥入醫療領域，有醫界人士也主張氣候變遷導致生病的人變多，但當時他跟邱泰源說「那錢（碳費）才一點點，衛福部錢比我們多，且碳費用途也沒醫療這項目，若真要撥入醫療領域，須先做關聯性分析。」
彭啓明16日在我國駐歐盟及比利時代表處大使李淳陪同下，率同仁前往歐盟相關機構，就氣候變遷、碳交易、空品管理等環境議題進行交流，他在訪歐時曾向歐盟承諾，台灣4年內將啟動溫室氣體總量管制與排放交易制度，並表示，台灣已於今年8月底公布碳費三項子法，將試行今年度碳費申報，明年正式開徵碳費；環境部也規劃4年內啟動總量管制與碳排交易，向國際展現台灣落實減碳的具體措施。
歐盟2005年建立碳排放交易系統（Emission Trading System，ETS），是目前國際上運作最成熟、也是全球最大的碳排放交易市場，具相當豐富執行經驗。
至於醫療院所進一步節能減碳，彭啟明表示，透過能源技術服務業（ESCO），以保險基金方式會比較快，環境部就是想幫醫院找到足夠資金做減碳，才會啟動跟經濟部與金管會的合作。
邱泰源今天稍晚被問及爆料一事說，他和彭啟明是非常好的朋友，過去一直與其它醫界朋友共同推動淨零減碳、健康城市工作，兩人在院會中也常坐在隔壁，甚至會竊竊私語討論問題，跟環境部不可能有溝通不良現象。他說，「自己跟行政院長卓榮泰也常常通電話溝通，且一定遵守行政制度，把事情解決最重要。」
但突然爆料仍讓外界認為是否行政團隊網內互打？對此，政院方面表示，邱泰源談話是強調整個內閣團隊的施政效率及求好心切，無關所謂負面批評，也沒有炒作的意義。而針對醫療機構排碳大戶減碳問題，行政院發言人李慧芝說，對各產業營業場所的減碳，如節能或淨零建築都是淨零轉型重要工作項目。她強調，行政院目前設有跨部會協調機制，各部會將積極協助業者。
