24日偕副手吳欣盈登記參選後，民眾黨總統候選人柯文哲25日整天沒有公開行程，引發外界關注。柯文哲晚間在臉書發文說，「這段時間因在野整合問題，不只是我自己、我的團隊，所有關心政局的台灣民眾，都需要一點時間消化」，他也批評國民黨認為藍白合就可高枕無憂，為了政黨最大利益，想方設法當正的，民眾黨願接受整合，但還是要尊重科學、回應民意，不能只是用傳統的分配、用喬的。
柯文哲晚間在臉書指出，「正式登記參選後第一天，我沒安排公開行程。這段時間因為在野整合的問題，不只是我自己、我的團隊，所有關心政局的台灣民眾，都需要一點時間消化。今天東北季風報到了，天氣是冷了一點，但天空非常晴朗。」
對整合破局，柯文哲認為，可歸咎於雙方從一開始就有認知差異。他可以適度退讓，唯一堅持是在野一定要贏，所以一定要是最強組合。一定要預想到未來選戰短兵相接，民進黨必定會無所不用其極的攻擊。無論是政策、辯論、議題主導，總統參選人首當其衝，「但國民黨想的是反正藍白合就會贏，可以高枕無憂，所以為了政黨最大利益，想方設法當正的，沒有第二選項。」
柯文哲表示，17日三位專家會議討論後，民調清清楚楚「柯侯配」明顯強過「侯柯配」組合，甚至有的民調，侯柯配組合只能險勝賴蕭。專家會議一路開到凌晨，國民黨代表堅持他所承諾的「讓統計誤差值」，等於正負3%相加，極大要讓到6%（或所謂的5.96%）。「這是曲解我的原意，也無法反應真實民意，因為在真正的總統大選時，賴清德連0.001%都不會讓。民眾黨願意接受整合，但還是要尊重科學、回應民意，不能只是用傳統的分配、用喬的。」
柯文哲說，「兩黨總統合作的列車暫時分開，但終點沒有變，2024政黨輪替要有人完成」。
柯介紹他的副手吳欣盈，是現任立法委員，她認真獨立有衝勁、充份具備國際觀。她在立法院短短一年已展現她的能力。擔任立委期間，吳欣盈一天當作三天用，挺著孕肚準時簽到質詢及主持公聽會。
柯文哲說，「台灣的前途應該由人民決定，過去我花了很長的時間、很大的力氣做在野整合。四腳督絕對打不贏，所以我不只與國民黨、朱主席、侯參選人溝通、也積極與郭台銘創辦人對話，希望團結一切力量。」
「如今藍白雖然總統層面不能合，但所幸我仍與郭董取得共識，他為了台灣的未來，願意退讓，我則會堅定地走下去，面對未來的諸多挑戰，很多人用沒錢沒資源唱衰我們，但我一點也不害怕。」柯文哲說，因為人民的力量將深化新一波民主改革，「因為這場戰爭，不是只有柯文哲一個人在打，我相信更多志同道合的夥伴，會開始集結，堅持選哲，盈向勝利的終點！台灣選哲，一定會贏！」
