國民黨立委徐巧芯日前揭露，民進黨立院黨團總召柯建銘透過隨扈，在2013年投資大陸卻欠款未還；柯建銘表示將控告徐巧芯、《美麗島電子報》董事長吳子嘉等人刑事加重誹謗。吳子嘉今（6日）在《美麗島電子報》重貼柯建銘涉貪舊聞，予以反制。
徐巧芯今天表示，她日前爆料柯建銘之事時，並未和吳子嘉聯繫，結果得知吳子嘉也被告，便致電詢問吳子嘉為何遭告？吳子嘉告訴她，今日會貼出《美麗島電子報》2016年1月〈柯建銘、陳水扁涉嫌買票、圍標、恐嚇受刑人〉、〈柯建銘為何不告李界木？作賊心虛？〉等2文。
根據《美麗島電子報》此前報導，民進黨前立委王幸男於2012年在《自由時報》刊登公開信中點出兩段民進黨「黑歷史」，一是當年前總統陳水扁曾同意柯建銘拿3千萬元，幫助現任總統府資政姚嘉文競選考試院長；另一件是陳水扁及其幕僚馬永成與柯建銘，曾在總統府內逼中科管理局局長李界木違法圍標。
第一件爆料，2002年「民進黨高層」同意出資3千萬元，協助姚嘉文競選考試院長，並先由柯建銘調度現金。但事後柯建銘未將款項交還出資人，經出資人乾媽許榮淑出面協調無效，只好透過南部蔡姓立委向柯建銘強力催討。據了解，這位「民進黨高層」就是陳水扁本人。
第二件爆料，是當年中科汙水放流工程，柯建銘涉藉立法院黨團總召身份，以籌措總統競選經費為名，要求主事者交付工程審議委員名單及指定得標廠商。柯建銘涉嫌介入的工程弊案名稱是「中部科學園區、台中基地汙水放流管線工程第四標」。
徐巧芯說，吳子嘉會貼出舊聞，是因為他都已掌握柯建銘這麼多歪七扭八的事情，柯居然還告他？
徐巧芯也表示，眾所周知吳子嘉跟總統賴清德關係不錯，吳子嘉告訴她，現在柯建銘在賴清德視野中已愈來愈遠，變成「邊緣人」。所以柯建銘為何要罷免41名藍委、把這種髒活攬在自己身上，就是要告訴賴清德「我老柯不是好惹的」、「下一屆不讓我當總召的話，我要做的事可能你們無法想像」，這其中有表功、有立威，讓民進黨整個黨，包括賴清德，都被柯建銘一人挾持，賴清德搞不好也挺怕柯建銘的，因此接下來民進黨立院總召可能還是讓柯建銘擔任。
徐巧芯笑說，她個人是非常歡迎柯建銘繼續當總召，因為柯每次表決都沒來，有時兩邊票數非常接近，就缺柯建銘那一票，「所以謝謝柯總召，沒有為民進黨投下關鍵一票，就是支持國民黨！」
