總統賴清德13日召開國安高層會議，宣布將恢復軍審制，針對軍人涉犯叛亂、利敵、洩密等軍事犯罪案件，交由軍法體系審理，引發外界熱議。對此，國民黨立委徐巧芯強烈批評，賴清德恢復軍審的目的，並非出於對軍事司法體系的完善考量，而是為了在軍隊內部揪出共諜。她質疑，賴身為三軍統帥，卻選擇以這種方式處理國軍問題，形同不信任軍人，讓志願役官兵感到寒心。
賴總統宣布恢復軍審制度，引發外界高度議論，執政黨強調此舉有助於國安防衛，但在野黨則質疑政策轉彎，並抨擊政府不信任軍人。徐巧芯在接受網紅「館長」陳之漢訪問時指出，國民黨立委翁曉玲、陳永康及她本人曾於去年提案修正《軍事審判法》，主張將現役軍人涉犯《陸海空軍刑法》及普通《刑法》案件，回歸軍法體系審理。
但她強調，藍營當時的修法動機，是為了確保軍事審判符合專業需求，如一般法官可能不理解軍隊文化，導致審判與軍紀管理脫節，這與賴政府現今強調的「國安防諜」立場截然不同。
根據賴總統在國安會議後談話指出，近年來國軍遭滲透情況嚴重，2023年共諜案中，涉案現役及退役軍人占比高達66%。為因應日益升高的國安威脅，政府決定全面檢討《軍事審判法》，讓軍法官回到第一線，處理相關案件，以強化國防安全。
國防部則表示，自2013年《軍事審判法》修法後，軍事案件已改由司法機關處理，僅保留戰時審判功能。但長期觀察發現，透過內部訓練及軍法官借調至檢察署模式，無法有效維持軍法系統運作。因此，經過通盤檢討後決定推動軍審制度的恢復，以確保平戰轉換順暢，達到維持軍紀與保障人權的雙重目標。
對賴政府此舉，徐巧芯質疑，民進黨過去支持廢除軍審，如今卻又宣布恢復，顯示政策反覆，缺乏一致性。她批評執政黨，至今尚未提出具體修法版本，擔憂只是為後續政治操作，藉機攻擊在野黨。
徐巧芯說，去年國防部已推動《陸海空軍人懲罰法》、《陸海空軍人權益保障法》作為軍審法的替代方案，當時在野黨支持法案通過，如今賴政府卻又重提軍審，令人質疑其真實動機。
