為落實國家轉型正義並回應總統賴清德加速開放檔案的指示，國安局今（23）日宣布，歷經1年4個月的自主清查，已將民國81年以前（含戒嚴時期）的政治檔案全數解密，完成「一件不留、一字不遮」的目標，並將實體檔案併同電子影像檔移交國發會檔案局，總計清查逾56萬件檔案，其中5萬1133件為政治檔案，範圍涵蓋保防制度、反動出版品調查及海外台獨團體活動等核心史料，盼將台灣民主發展脈絡，以及國家歷史記憶永續傳遞。
國安局表示，自民國113年（西元2024年）11月起，即動員全局人力，主動依現行「政治檔案條例」及國發會檔案局「政治檔案審定原則與重點」，分兩階段全面自主清查民國81年（西元1992年）以前（含戒嚴時期）全部檔案。
第一階段，清查國安局民國81年以前所有檔案，總計2萬3757卷、56萬6415件，並將清查結果及目錄造冊送國發會檔案局審定在案，該局於114年（2025年）6月審定為政治檔案者，共計1369卷，5萬1133件。第二階段，針對國發會檔案局審定的5萬1133件政治檔案，國安局以人工方式，採逐卷、逐件、逐頁檢審，並進行檔案解密及掃描作業。
國安局已將前述81年以前政治檔案全數解密，並依規定公開檔案所有內容，不予遮蔽。實體檔案經封裝成94箱，連同電子影像檔分批送交國發會檔案局，並於今日全數移交完畢。此次解密移交檔案內容，涵蓋戒嚴時期保防安全工作制度、情報機關偵保防業務資料、反動文化出版品與黑函調查、國人入出境管制、海外台獨團體活動、叛亂案件人員資料與判決書等檔資。
國安局表示，在自主清查檔案過程中，也針對部分歷史檔案是否曾遭銷毀一事，進行逐卷、逐件檢視。然早年檔案由承辦人員「併卷」歸檔，「卷」內並無逐「件」檔案登載文號，致無從判斷當年檔案資料是否曾遺失或遭銷毀。國安局是自民國94年（西元2005年）起，開始將民國90年（西元2001年）以前檔案，重新按「件」編貼流水文號。
國安局宣稱，政治檔案開放對真相調查、還原歷史及促進社會和解，具有高度重要性。總統賴清德去年出席「228事件78周年中樞紀念儀式」致詞時，指示政府應加速政治檔案開放，追查歷史真相。
國安局依照局長蔡明彥「面對歷史、還原真相」及「一件不留、一字不遮」指導原則，進行本次戒嚴時期政治檔案的清查解密及移交作業，期盼將台灣民主發展脈絡，以及國家歷史記憶永續傳遞，並展現國安局「服膺憲法」、「依法行政」的工作信念。
另外，民國89年（西元2000年）至113年10月期間，國安局即已配合國發會檔案局辦理8批次檔卷清查移交，加上本次自主清查作業，總計已解密並移交國發會檔案局1871案、4685卷、14萬0758件檔案。
