賴清德10日宣布新內閣人事，其中，朝野普遍認為「留下大量爛攤」的衛生福利部長薛瑞元，目前傳出有望繼續留任。薛瑞元今天被媒體問到是否可能繼續留任，他未正面回應，僅表示「我不知道，我現在一無所悉」。
疫情後，台灣醫療衛生界面臨許多挑戰，包括健保給付過低、醫護人員離職潮、以及食品安全等問題，急迫需要一位經驗豐富的「老舵手」來穩定現況。由於薛瑞元接掌衛福部後始終未妥善處理這些重大議題，因此，一旦衛福部長換人，被形容是「留下大量爛攤」。
由於問題重重，因此，傳出內閣尋覓部長人選時並不容易，因而有意繼續讓薛瑞元留任處理機年未解的難題，續任呼聲頗高。
在賴清德新政府首波內閣人事布局中，民進黨前主席卓榮泰及文化部前部長鄭麗君分別被任命為行政院正、副院長。而薛瑞元對於自己是否留任，則回答「我不知道，我現在一無所悉」。
但除了薛瑞元，賴清德的恩師、前成大醫院院長陳志鴻也是被廣泛討論的人選之一。不過，有立委私下表示，認為陳志鴻年紀較大，可能無法勝任衛福部長的重責大任。而現任健保署署長石崇良、醫師公會全聯會前理事長邱泰源等人也都在候選名單中。
衛福部面臨的最大挑戰之一是健保制度的改革，多年來積累的問題需要強大的決心和措施來解決。賴清德在選前提出的「健康台灣」政見，對熟悉醫療政務的人選來說，無疑是一項重大挑战。因此，薛瑞元留任的可能性被外界看好，他對於是否留任的問題選擇保持沉默，僅以「一無所悉」來回應媒體的追問。
此外，近期由於藝人黃子佼被發現持有未成年少女不雅影像，引發社會對兒少性剝削問題的高度關注。對於修法加重持兒少性影像刑責的呼聲，薛瑞元表達了樂觀其成的態度，期待立法院能夠有所作為。
