2018年教育部「卡管案」引發爭議，立委今天（27日）表示，新任教育部長鄭英耀當時還是高雄中山大學校長，雖未公開反對卡管，但是私下表示「卡管是不對的」，並向鄭英耀證實是否有此事？鄭英耀則表示願意承諾絕對不會讓政治凌駕教育。
2018年1月台灣大學遴選出校長管中閔，不料教育部以「此案有嚴重瑕疵」為由拒發聘書，衍生出一連串爭議，1年內竟導致潘文忠、吳茂昆、葉俊榮等3任教育部長下台。鄭英耀今日（27日）首度赴教育與文化委員會業務報告並備詢，國民黨立委洪孟楷問到，當時鄭英耀擔任中山大學校長，政治大學教授周祝瑛說鄭英耀曾向她坦承「拔管案是不對的」，鄭英耀願意證實嗎？
鄭英耀表示跟周祝瑛算是學長、學妹關係，他關切大學的學術自主，希望從學校機制來做。洪孟楷問：「所以你有說過『卡管案是不對的』這句話嗎？」鄭英耀表示，時間太久不記得，但他認為高等教育應該從專業出發、從學術出發。
洪孟楷表示，過去8年蔡政府的教育成績單，尤其是拔管案和論文抄襲案這2件事，嚴重傷害大學自主與學術倫理。「所以我們才希望在新任教育部長首次赴立法院教育文化委員會的時候，希望你能諾，任內不會有任何傷害學術倫理的事情。」 鄭英耀表示絕對會捍衛學術倫理。
國民黨立委柯志恩質詢時表示，台灣歷任教育部長中，杜正勝可說是政治立場最強烈，他任內把台灣地圖倒過來等作法爭議非常大。鄭英耀過去政治立場非常鮮明，這是他個人選擇，但是必須提醒，教育部長這個位置最忌諱把政治帶入教育，政治更是不能凌駕教育：「您是否可以承諾，絕對不要把個人意識形態帶入教育？」
鄭英耀表示，他關心台灣教育，一定會以教育為本業從專業出發。
柯志恩說，2018年7月，曾經有14位在任的公立大學校長成立「全國大學自主聯盟」，站出來聲援台大遴選出來的校長管中閔，痛批教育部傷害大學自主。之前洪孟楷也提到，鄭英耀當年雖然沒有站出來反對卡管，但是曾私下表示卡管是不對的。柯志恩說，她不會問鄭英耀當年若是教育部長，是否會做得比較好；但他是否可以承諾不要讓政治凌駕教育？鄭英耀承諾一定會做到。
