海基會董事長吳豊山近期找政學界友人聚餐表示，他的確是賴清德總統徵詢擔任海基會董座的第一人，賴去年1月當選後，3月就徵詢他出任海基會董座意願。他說，賴清德當時賦予他的任務就是「能為兩岸做點事」；但去年520總統就職演說後，賴清德被定調「台獨」，找誰當董座其實都難施展了。
今年6月7日海基會召開董監事會，推舉鄭文燦接董座，副董事長由許勝雄及兼秘書長的羅文嘉出任。吳豊山友人轉述，賴清德3月徵詢吳豊山意見後，4月25日宣布鄭文燦接任海基會董座，是受到蔡英文的影響。一方面，鄭文燦雖與賴同為新系，但小英執政時期鄭文燦早倒向英系，2023年初蘇貞昌閣揆由陳建仁接任後，小英安排鄭文燦在輔選2022「九合一」桃園選戰失利後出任副閣揆，就是培養他與賴清德成為「後蔡時代」的競爭對手。
只可惜桃園市長輔選大敗，雖高升副閣揆，也折損鄭文燦在黨內不少威望。2024總統大選賴清德勝出，黨內早有「瑜亮情結」的賴鄭，就更難有合作空間了。
吳豊山友人說，在鄭文燦「出事」後，賴清德總算名正言順讓他「最屬意的人選」走馬上任，賴對吳豊山的期望就一句話「為兩岸做點事」，具體說就是「恢復兩岸對話」。
吳豊山，大陸能接受嗎？大陸學者、上海台研會長嚴安林及交大台研中心主任盛九元日前訪台，曾與其接觸的台灣學者透露，大陸學者認為大陸對吳豊山不會有太大意見，畢竟他是「無黨籍」人士，且某些立論還算客觀，對兩岸關係有一定了解。但重點是，不管誰主掌海基會，如果不承認「九二共識」、又找不到兩岸可接受的替代方案，兩會（海基會、海協會）要「解鎖」幾乎不可能。學者說，「被稱老男藍的李大維掌海基會，不也沒用嗎？」
吳豊山自去年10月接掌海基會後，已對兩岸提出一些觀點，如去年底與媒體餐敘說，他承擔的使命就是設法恢復兩岸對話，他上任迄今已作一些努力，不過還未看到成績，但他深信，交流、對話、和平發展，才能增進兩岸人民福祉，會與海基會同仁繼續努力。
不過做為兩岸窗口，吳豊山也希望內部同仁講話盡量展現和平與善意。吳的學界友人透露，去年12月17日雙城論壇舉辦前，海基會秘書長羅文嘉12月13日開記者會炮口指向蔣萬安說，有3名台籍一貫道道親10月上旬赴廣東中山進行宗教活動遭捕，音訊全無、下落不明，「我要提醒台北市長蔣萬安，應多關注這類事情，這比雙城論壇還重要」。羅文嘉談話後被北市副市長林奕華酸，「海基會管道沒了？」對此，吳豊山私下不太高興，對友人抱怨「羅文嘉這個話不適當」，他說，你（羅文嘉）有意見私下對蔣萬安說就好，沒必要拿到檯面上說。
這也讓學界擔憂，賴政府的海陸兩會似乎充斥不同調。比如去年520後陸委會副主委梁文傑在廣播節目稱「兩岸實質就是兩個國家」，讓外界以為520後兩岸關係生變，但接掌陸委會不久的邱垂正為此出面澄清：「政府立場一貫，兩岸關係就是兩岸關係。」羅文嘉不僅公開要台北市做海基會工作引爭議，去年10月前往馬祖提「二六共識」，恐也未獲海基會、甚至陸委會授權。
嚴安林、盛九元本月5至10日訪台，據悉訪團成員原有8位，早在去年9月就提出申請，但層層審核後延至今年1月才成行，成員僅剩2人。陸委會副主委兼發言人梁文傑日前被問及大陸學者訪台說，「交流互動是好事情」。至於來台接觸綠營智庫，知情人士透露，大陸官方底線是「不主動接觸」。因此，亞太和平研究基會執行長董立文主動致電宴請聊聊，嚴安林等便允諾，畢竟過去是舊識。
至於本月6日與國策研究院閉門座談，除國策院副院長郭育仁、執行長王宏仁出席外，學界出席的有淡大兩岸關係研究中心主任張五岳、中研院歐美所研究員林正義及警大公共安全學系副教授游智偉等人，但大陸學者認為台媒解讀不正確，國策院雖由曾任扁時期外長的田弘茂主持，但是張榮發旗下民間智庫，不必歸類到綠營智庫。
此外，大陸對蔡、賴「寬嚴」不同調，讓台灣學界很納悶。蔡英文2016年起執政8年，但大陸對台任何批評，從未點名「蔡英文」；去年520後，國台辦則幾乎大小事都點名「賴清德」或「賴清德當局」，相較蔡英文更不留餘地，這對未來尋求兩岸轉圜更增難度。
對此，大陸學者認為，蔡賴執政仍有很大不同。蔡英文提出的「四個堅持」是，「永遠堅持自由民主的憲政體制；堅持中華民國與中華人民共和國互不隸屬；堅持主權不容侵犯併吞；堅持中華民國台灣的前途，必須遵循全體台灣人民的意志。」大陸學者指出，四個堅持中，「主權」與「兩國論」分開敘述，小英單獨提「堅持主權不容侵犯併吞」，但賴清德不是這樣。
大陸學者表示，賴在520的就職演說，脈絡上明顯是「兩國論」及「台獨」的落實，他在520中提到，「我們都知道，有主權才有國家！根據中華民國憲法，中華民國主權屬於國民全體；有中華民國國籍者，為中華民國國民；由此可見，中華民國與中華人民共和國互不隸屬。」對此，大陸學者認為，賴清德強調的是「兩岸主權互不隸屬」，與小英「兩岸（中華民國／中華人民共和國）互不隸屬」，層次自然不同，嚴重性也有區別。
「海峽兩岸互不隸屬」即使馬英九執政時也提到，是根據中華民國《憲法增修條文》對台海現狀與海峽兩岸關係的一個官方陳述，這說法也長期被陸委會使用，只不過在蔡英文政府任內首次成為獨立的政策方針，並被繼任賴政府大幅沿用，但談話前後脈絡是否指涉「主權」應是北京最看重的一點。
