近日臉書上有海巡爆料，上級把基層同仁變成監控網路言論的工具，逼人蒐集、截圖、整理「批評政府」的貼文，這已經超越公務職責，變成道德與良心的逼迫；而早在今年5月，就有海巡爆料相關事件，甚至依據官階每周有KPI。對此，海巡署表示，這是為避免民眾誤入中共認知作戰的陷阱，因此請所屬「掌蒐與海巡署相關議題，或影響國家安全、社會安定等重大爭議訊息」。
臉書粉專「爆料海巡2.0」日前疑由基層發出編號2946文表示，海巡守海、守漁、守人民的安全，不是為了替任何政黨擦拭面子。現在竟然有人把「誰在罵政府」當成安全情報下發，完全扭曲職務本質。貼文指稱，民進黨執政、朝野之爭、政策好壞可以被拿出來檢討；但把基層同仁變成監控網路言論的工具，逼人蒐集、截圖、整理「批評政府」的貼文，這已經超越公務職責，變成道德與良心的逼迫。
該名海巡基層呼籲，立刻下令停止一切以「蒐集批評／民間言論」做為所謂安全情報的行動，並公開說明相關指令的來源與範圍；立即啟動獨立調查外部或第三方是否存在不當指令、是否有越權蒐集、以及有無逼迫基層同仁行為，調查結果必須公開。
他續指，第三點是為受到壓力或被逼蒐證的同仁提供保護與申訴管道，承諾不會因檢舉或申訴而遭到報復；並就查證結果對相關責任人進行懲處。若上級不願透明回應、或持續以績效壓榨基層，他保留把具體事證與案例揭露給媒體與相關監督機關的權利。網路輿情蒐集是有其專業與範圍的，但絕不能成為壓制言論與逼迫員工昧良心的工具，強調「我們捍衛的是國家與人民，不是政黨的顏色，請立即停止，把良心歸還給基層」。
而早在今年大罷免期間，同個粉專就有人爆料，海巡署請同仁在臉書尋找假帳號，尤其是長期於個人臉書發布對台政治、攻擊執政黨及提倡兩岸統一的言論，都有可能是境外異常帳號操作認知作戰。上級更指出，可以到各大一直批評執政黨或台灣政治的臉書粉專尋找，並貼到群組。其中，少校（含）以上安檢所每周2篇，少校以下安檢所、巡邏站每周一篇。遭網友批「海巡署變成了思想警察，罵政府就被認定是認知作戰，大家發文不要罵政府，不然什麼時後被抓走都不知道」。
對此，海巡署表示，中共持續結合軍演、灰帶侵擾等活動，刻意散布有關海巡的虛假信息，為避免民眾誤入中共認知作戰的陷阱，海巡署因此請所屬「掌蒐與海巡署相關議題，或影響國家安全、社會安定等重大爭議訊息」，並蒐查疑似中共操縱的異常帳號，將虛假或爭議訊息報由海巡署或權責機關及時更正，以安定我民心士氣。
海巡署說，海巡恪遵「行政中立」的立場不變，將以最堅定的立場及行動，捍衛我國主權與民主，保護民眾生命財產安全。
網友表示，「靠腰！我整天罵政府！！」、「多找走私及保護著漁民才是正道」、「連海巡署都管那麼大、不愧是住海邊的」、「難怪預算需要這麼多」、「網路海巡看來也是海巡署的業務」、「抨擊朝政 是要殺頭的！」、「輿論情搜不是有國安局跟調查局這些單位嗎，現在是打算動員整個公務體系對人民的言論自由實施監控嗎？」、「真的在海巡」、「看到這則的海巡兄弟辛苦了，每天幾萬則講實話的都要匯報給黨，不容易」。
