國民黨主席鄭麗文14日批評賴清德總統，指他上任後面對朝小野大的國會結構，未能展現尊重國會多數的憲政態度，反而多次以行政手段對抗立法院通過的法案與預算，已引發外界對憲政運作的嚴重疑慮。國民黨團書記長羅智強批評，賴、卓榮泰院長若一意孤行，賴清德即將成為台灣版的韓國前總統尹錫悅。
鄭麗文表示，依中華民國憲政體制，行政院雖可依法提出覆議或聲請釋憲，但前提應是尊重國會的立法權與監督權，而非將制度工具化、政治化。她直言，若國家領導人帶頭否定憲政運作原則，將構成重大憲政危機，社會不應等閒視之。行政部門若一再否定國會多數決結果，卻僅以「喝茶溝通」作為回應，無助於解決問題，反而恐加深政治對立。
羅智強也指出，賴清德與行政院長卓榮泰在多項爭議法案與預算案上態度強硬，頻頻動用覆議及釋憲程序，形同與國會正面衝突。他批評，賴、卓若持續一意孤行，恐破壞憲法所設計的權力制衡機制，並警告此一情勢已引發社會不安。他提醒，「昨日尹錫悅、今日賴清德」，若賴總統一意孤行下去，尹錫悅的下場，足堪為借鏡。
尹錫悅在2024年12月因宣布戒嚴而引發政治危機後，韓國國會通過彈劾動議，指其宣佈戒嚴及相關行為違反憲法。憲法法院於2025年4月一致裁定通過彈劾案，使他喪失總統職務，成為繼前總統朴槿惠之後，第二位被彈劾下台的南韓總統。
我國賴清德就任總統以來，民進黨在立法院未取得過半席次，國會權力結構出現轉變。其後，立法院陸續通過多項涉及國會職權、行政監督及預算分配的法案，行政院則對部分法案提出覆議，並聲請司法院釋憲，相關作為引發是否違反權力分立精神的討論。
對於外界質疑，賴清德多次強調，行政院相關作為均依憲法與法律程序進行，目的在於維護憲政秩序與人民權益，而非否定立法院職權。他也表示，願意透過溝通協調，與各界交換意見，尋求朝野最大共識。
不過，近來部分平面媒體與評論版面，已連日關注行政、立法之間的緊張關係，並對行政權是否過度介入立法權運作提出質疑。相關討論聚焦於覆議與釋憲的頻率，以及行政部門是否能在程序合法之外，進一步回應政治正當性的問題。
在野黨認為，憲政民主的核心在於權力制衡，而非行政權凌駕立法權，若執政者無法妥善面對少數執政的政治現實，長期以制度手段對抗國會多數，恐削弱民眾對憲政體制的信任。
學界人士則指出，在雙首長制架構下，當行政、立法權分屬不同政治陣營時，制度磨合與政治協商的重要性將更加凸顯，後續發展仍有待觀察。
